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Approximately 24 to 48 hours later or, in the case of this research, 90 hours later , the kefir grains have consumed the nutrients available to them. The grains grow in size and number in this time and the kefir process is complete.

The grains are removed and added to fresh milk to begin the process anew. For scientists, however, kefir provides more than just a healthy beverage: While scientists know that microorganisms often live in communities and depend on their fellow community members for survival, mechanistic knowledge of this phenomenon has been quite limited. Sonja started this research by gathering kefir samples from several places.

Kefir microbial communities have many member species with individual growth patterns that adapt to their current environment. However, the kefir community had a lot of lead time for co-evolution to bring it to perfection, as they have stuck together for a long time already.

Finding out the extent and the nature of the cooperation between kefir microbes was far from straightforward. This revealed not only key molecular interaction agents like amino acids, but also the contrasting species dynamics between the grains and the milk part of kefir.

If you look at the whole world of microbiomes, cooperation is also a key to their structure and function. In this second paper, the researchers used advanced metabolic modelling to show that the co-occurring groups of bacteria, groups that are frequently found together in different habitats, are either highly competitive or highly cooperative. While both competitive and cooperative communities are prevalent, the cooperators seem to be more successful in terms of higher abundance and occupying diverse habitats.

Nature Microbiology , DOI: When microbes feed each other. How wine-making yeast can feed wine-spoiling bacteria. Molecular cuisine for gut bacteria. Liang Xue used cryo-electron tomography to capture this detailed image of a Mycoplasma pneumoniae cell.

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